男性畸形精子症的危害有影响正常生育、影响生活质量、影响精子质量、可能会导致不育等情况。建议畸形精子症的男性患者及时到医院男科就诊，通过精液检查、内分泌检查等明确具体情况，并积极进行治疗。

1、影响正常生育：畸形精子症的男性患者，精子畸形率超过20%，可能会影响正常生育，导致男性不孕不育。正常生育受到精子质量、畸形率等多方面影响，一旦出现精子畸形，受精后胚胎质量也会较差，可能会导致流产、胚胎发育不良等情况;

2、影响生活质量：畸形精子症的男性患者，由于精子畸形，可能会导致精子在质量上出现问题，从而影响正常生活、工作。由于精子畸形率较高，可能会导致在日常中工作或生活中的安全隐患减少，容易导致疾病发作;

3、影响精子质量：畸形精子症的男性患者，由于精子畸形率较高，可能会导致精子DNA碎片率增加、核蛋白不完整，从而影响精子质量，导致受精后胚胎质量较差，可能会导致流产、胚胎发育不良等情况;

4、可能会导致不育：如果男性患者长期处于畸形精子症的状态，还可能会导致睾丸萎缩、生殖器畸形等情况，容易导致生殖功能受到影响，从而出现不育的情况。

建议畸形精子症的男性患者在医生的指导下使用枸橼酸氯米芬胶囊、硫辛酸片、他莫昔芬片等药物进行治疗。如果药物治疗效果不佳，可以通过手术进行治疗，如腹腔镜下精索静脉结扎术等。